A Pós-graduação da ESCS  é dividida em duas coordenações:

Coordenação de Cursos de Pós-Graduação Stricto Sensu (CPGS) que tem por objetivo coordenar e supervisionar a execução dos cursos de Mestrado e Doutorado Interinstitucional (DINTER) em parceria com a Universidade de Brasília (UnB).

Coordenação de Cursos de Pós-Graduação Lato Sensu e Extensão (CPLE) que tem por objetivo coordenar e supervisionar as atividades pedagógicas referentes aos Programas de Residências Médicas e Residências em Áreas Profissionais da Saúde, aos Cursos de Especialização e Extensão, em consonância com seus marcos regulatórios.

COORDENAÇÃO DE CURSOS DE PÓS-GRADUAÇÃO STRITO SENSU (CPGS)
Coordenadora: Carmelia Matos Santiago Reis
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Telefone: (61) 2017.1145 ramal 6868

GERÊNCIA DE CURSOS DE MESTRADO E DOUTORADO (GCMD)
Gerente: Levy Aniceto Santana
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Telefone: (61) 2017.1145 ramal 6869

COORDENAÇÃO DE  CURSOS DE PÓS-GRADUAÇÃO LATO SENSU E EXTENSÃO (CPLE)
Coordenadora: Vanessa Dalva Guimarães Campos
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Telefone: (61) 2017.1145 ramal 6867

GERÊNCIA DE RESIDÊNCIA, ESPECIALIZAÇÃO E EXTENSÃO (GREEx)
Gerente: Sérgio de Souza Marques
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Telefone: (61) 2017.1145 ramal 6867

NÚCLEO DE  ESPECIALIZAÇÃO E EXTENSÃO (NEEx)
Chefe: Anelice da Silva Batista
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Telefone: (61) 2017.1145 ramal 6867